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0. Preface
对于关键残基的识别、配体结合、突变效应和长距离相互作用等过程，从大分子动力学轨迹中提取的动态互相关性信息是非常重要的。
下图即是一张Bio3D绘制的某蛋白的动态互相关矩阵（DCCM）图。
做蛋白质相关的模拟，难免经常遇到有需要分析DCCM的场合，这篇小文就简单介绍DCCM相关的一点儿内容，包括数学过程以及目前能够计算DCCM的几种工具。
1. 一些儿数学过程
我们都很清楚方差的概念：
σ ( x , x ) = < ( x −
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