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用于菌群结构谱或宏基因组测序分析的皮肤微生物取样方法 江舜尧

时间:2021-11-22 02:07:06

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用于菌群结构谱或宏基因组测序分析的皮肤微生物取样方法 江舜尧

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一、样本筛选

1、如果受试者存在以下情况,则需剔除:(1)采样前7天,脸部,头皮,脖子,胳膊,前臂或者手使用过抗生素或者萜类物质者;

(2)脸部,胸部,背部或者肩膀有痤疮者;

(3)头皮,脸,脖子,手臂,前臂或者手上有水泡,脓疱,疮,脓肿,腐烂或者溃疡者;

(4)在4c2取样部位处有一处水泡,脓疱,疮,脓肿,腐烂,溃疡,藓,伤口,裂纹或者色素及粉红色的皮肤修复区者;

(5)身上有多处粉色或红色皮肤区域者(暗指牛皮癣或者湿疹患者);

(6)手掌或者脚掌皮肤增厚或者有裂纹者;

(7)两周之内,每天使用去屑洗发水都不能清理干净头皮屑者;

(8)身体一处或者多处有散发型皮疹者。

2、志愿者的皮肤检查要在灯光良好情况下进行,并且要对全身有全面彻底的检查。

3、耳后的折痕(左右耳后面)和两个胳膊腋窝要仔细检查。

二、准备材料

1、无菌螺旋盖收集管(如 MoBio 收集管);

2、无菌生理盐水;

3、标签纸;4、Mark 笔和签字笔;

5、无菌脱脂棉签;

6、密封塑料袋;

7、-80°C冰箱;

8、一次性手套;

9、碎冰或冰袋,最好是干冰;

10、冰盒。

三、收集方法

1、在无菌拭子管管盖和管壁上都写上样品名称,注意,样品名称只能用英文字母或阿拉伯数字或两者的组合,而且字符数不小于3且不大于9;

2、将无菌的脱脂棉签在无菌生理盐水中浸湿,在实验目的区域擦拭30s,擦拭面积4c2;

3、样本采集后应放入无菌螺旋盖收集管;收集好收集管后,用自封袋封存,置于冰上,2h 内运输到实验室,-80°C保存。

四、人类皮肤常见菌群

一类为常驻菌群,较固定地寄生于皮肤,数量和菌种的组成保持相对稳定;另一类为暂驻菌群,主要存在于暴露部位的皮肤,其数量和菌类有很大的变化。此外,还有一些微生物偶尔存在于少数人体上,称为偶存菌,仅在短时期内附着于皮肤和增殖,此受环境及常驻菌群活性的影响。常驻菌群寄生在角质层表面和表皮的最外层中。常见的有:微球菌科(包括凝固酶阴性葡萄球菌、类球菌、微球菌属),棒状微生物(包括棒状杆菌属、短颈细菌属),丙酸菌属,糠秕孢子菌属。

五、送样方法

所有样品采集完毕后联系北京微生太科技有限公司取样。微生太将派送干冰到样品所在地,将样品放进派送干冰的泡沫盒,封严后交给物流师傅既可。

六、参考文献

1、Distinct cutaneous bacterial assemblages in a sampling of South American Amerindians and US residents, The ISME Journey, .

2、Skin Microbiome Imbalance in Patients with STAT1/STAT3 Defects Impairs Innate Host Defense Responses, J Innate Immun, .


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